| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 宮原亜瑠斗(4) | 宮崎西陸上 | 3'27"91 | |
| 2 | 工藤 寿仁(4) | 新光陸上 | 3'33"01 | |
| 3 | 安藤 正晃(4) | 日南ACｼﾞｭﾆｱ | 3'38"46 | |
| 4 | 矢野 侑典(4) | 久峰陸上 | 3'40"16 | |
| 5 | 大野 海人(4) | MSK.sc | 3'42"41 | |
| 6 | 寿崎 舜(4) | 東海ｱｽﾘｰﾄ | 3'43"44 | |
| 7 | 山下 真大(4) | ひむかＴ＆Ｆ | 3'44"39 | |
| 8 | 赤野 心治(4) | 宮崎西陸上 | 3'45"15 | |
| 9 | 佐藤 良亮(4) | 延岡南部 | 3'47"61 | |
| 10 | 山口 大輝(4) | WAVE宮崎 | 3'49"99 | |
| 11 | 山下 勇星(4) | 延岡南部 | 3'50"85 | |
| 12 | 原田 理生(4) | MSK.sc | 3'54"55 | |
| 13 | 牧之瀬 大(4) | 宮崎西陸上 | 3'55"59 | |
| 14 | 佐藤 柚輝(4) | 新光陸上 | 4'15"73 |